蛋白顺序性抗原决定簇的多参数综合预测

被引:62
作者
万涛
孙涛
吴加金
机构
[1] 北京电子工业部402医院
[2] 军事医学科学院基础医学研究所
关键词
抗原决定簇,蛋白质,计算机;
D O I
暂无
中图分类号
R392.12 [免疫细胞生物学];
学科分类号
摘要
通过分析氨基酸序列的某些参数,可达到预测抗原决定簇。但没有一种单参数预测获得较满意结果,故有必要进行多参数联立综合预测。选用6个参数加权叠加。首先假设形成表位的残基上的原子数正比于N2/3(N为整蛋白中残基原子数),再对34个共含169个已知抗原位点的蛋白进行训练性综合预测,选出最佳权重。结果表明,Hopp&Woods亲水性参数和Janin可及性参数在综合中很重要。对CRGP,SCX2-ANDAN,TNFA-HUMAN,SOMA-BOVIN,HS7H-HUMAN这5个已知位点蛋白进行回顾性分析,初次预测率为45.8%,再配以β-转角结构,二次预测率为47.4%,结果可提供实验参考。
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