海绵Pachychalina sp.体内细菌多样性的研究

被引：5

作者：

方再光

黄惠琴

蔡海宝

吕家森

鲍时翔

机构：

[1] 中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室

[2] 中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室海口

[3] 海口

来源：

微生物学报 | 2004年 / 04期

关键词：

海绵Pachychalina sp.; 16SrDNA; 细菌多样性;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2004.04.004

中图分类号：

Q93 [微生物学];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

通过非分离培养分析方法 ,直接从海绵体内提取细菌总DNA。以样品总DNA为模板进行PCR扩增获得细菌 1 6SrDNA。用 1 6SrDNA限制性酶切片段长度多态性 (ARDRA)和测序方法对南海湛江海域海绵Pachychalinasp .体内的细菌多样性进行了研究。在细菌 1 6SrDNA的ARDRA图谱中 ,大多数克隆的酶切带谱间存在差异 ;随机挑选2 2个克隆进行测序得到它们的 1 6SrDNA部分序列 ,大部分序列属于γ proteobacterium和α proteobacterium ,但有少数克隆序列与RDP数据库中收录的 1 6SrDNA序列间的相似性极小 ,不参与系统发育树的构建。研究结果表明海绵Pachychalinasp .体内细菌组成具有丰富的多样性。

引用

页码：427 / 430

页数：4