由于参与主体在资源禀赋、利益偏好和角色作用方面存在显著差异,异质性成员间的合作是当前农民专业合作社的本质特征。基于浙江省372家农民专业合作社的实证研究发现,农民专业合作社的成员结构从一开始就呈现高度的异质性,少数核心成员与多数普通成员并存。在成员异质性条件下,农民专业合作社在产权结构上普遍采用资本化方式,少数核心人员占有相对集中的多数出资额;控制权上主要由少数拥有一定资源和较多出资额的核心成员掌握;在利益分配机制上,在提取公积金、公益金和风险金之后,可分配盈余主要采取按出资比例和交易量(额)在社员之间进行分配,其中出资的作用相对突出。从激励相容的角度来看,当前的组织结构在聚集生产要素和降低代理成本方面体现了效率。