华东和日本两地为东亚地区重要组成部分,同属于中国-日本森林植物亚区。两地植物区系成分具有较高的相似性,两地共有连香树科(Cercidiphyllaceae)、三尖杉科(Cephalotaxceae)、领春木科(Eupteleaceae)、旌节花科(Stachyuraceae)等东亚特有科。华东和日本两地共有属约680多属。如柳杉(Cryptomeria)、双花木(Disanthus)、小勾儿茶(Berchemiella)等中国-日本分布属。还有为数众多的两地共有种,如涧边草(Peltoboykiniatellimoides(Maxim.)Hara)、黄山梅(KirengeshomapolamataYatabe)、蛛网萼(PlatycraterargutaSieb.etZucc.)、山涧草(ChikusichloaaquaticaKoidz.)、舟山新木姜子(Neolitseasericea(Bl.)Koidz.)和日本假繁缕(TheligonumjaponicumOkuboetMakino)等成分。这些共有成分表明了两区系间的密切联系。