副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究

被引:10
作者
金莉莉 [1 ]
董雪 [2 ]
王秋雨 [1 ]
李雪 [1 ]
吴琼 [1 ]
李继耀 [2 ]
机构
[1] 辽宁大学生命科学学院
[2] 沈阳市疾病预防控制中心
关键词
副溶血性弧菌; 基因外重复回文序列-PCR; 肠细菌基因间共有重复序列-PCR; 分型; 亲缘关系;
D O I
10.13344/j.microbiol.china.2008.03.032
中图分类号
R378 [病原细菌];
学科分类号
100103 ; 100705 ;
摘要
利用基因外重复回文序列-PCR(REP-PCR)和肠细菌基因间共有重复序列-PCR(ERIC-PCR)技术,对副溶血性弧菌进行了分子分型研究和亲缘关系的探讨,并使用Hunter和Gaston方法计算分辨力指数。结果显示40株副溶血性弧菌分离株均可扩增产生可重复的DNA指纹图谱,并且不同菌株基因组DNA的扩增条带具有多态性。根据SPSS10.0软件得出的树状图结果,REP-PCR可以把40株菌分为21个型,分辨力指数可达到0.953,优势菌型为G1型;ERIC-PCR可将40株菌分成4个型,分辨力指数为0.5。研究显示重复序列-PCR方法可以用于该菌分型分析,REP-PCR具有较好的分型能力。在两种PCR的DNA指纹图谱中,血清型O1群与O3群主条带均非常相似,表明它们之间亲缘关系密切。
引用
收藏
页码:389 / 394
页数:6
相关论文
共 7 条
[1]   病原微生物分子分型技术研究进展 [J].
李雪 ;
金莉莉 ;
王秋雨 .
中国公共卫生, 2007, (03) :373-374
[2]   沈阳地区2005年腹泻患者副溶血弧菌分离株的血清分群 [J].
董雪 ;
李继耀 ;
王冰 ;
李欣 ;
田晶 ;
赵常智 ;
高丹 .
中国卫生检验杂志, 2006, (06) :707-708
[3]   杭州地区2000-2002年副溶血弧菌的分子分型研究 [J].
张蔚 ;
潘劲草 ;
孟冬梅 ;
陈坤 .
中华流行病学杂志, 2006, (04) :343-346
[4]   食源性疾病监控技术的研究 [J].
刘秀梅 .
中国食品卫生杂志, 2004, (01) :3-9
[5]   一起由副溶血弧菌和嗜水气单胞菌混合感染引起的食物中毒 [J].
傅小红 ;
徐景野 ;
金晓霞 ;
杨志厦 .
中国卫生检验杂志, 2001, (03) :382-382
[6]  
分子克隆实验指南[M]. 科学出版社 , (美)J.萨姆布鲁克(J.Sambrook)等著, 1992
[7]  
Identification of Vibrio Isolates by a Multiplex PCR Assay and rpoB Se-quence Determination. Cheryl LT,Jayna SP,Nancy DP,et al. Journal of Clinical Microbiology . 2007