牛瘤胃未培养细菌中一个β-葡萄糖苷酶基因umbgl3A的克隆及鉴定

被引:17
作者
赵广存
段承杰
庞浩
封毅
许跃强
莫新春
唐纪良
冯家勋
机构
[1] 广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室
[2] 广西大学生命科学与技术学院
[3] 广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室 广西南宁
[4] 微生物及植物遗传工程教育部重点实验室
[5] 广西南宁
关键词
牛瘤胃; 未培养细菌; 宏基因组; β-葡萄糖苷酶;
D O I
10.16213/j.cnki.scjas.2005.04.023
中图分类号
Q785 [转化及克隆];
学科分类号
071007 ; 0836 ; 090102 ;
摘要
通过构建牛瘤胃未培养细菌的宏基因组文库,共获得12000个克隆,文库外源DNA总容量为4.2×108bp,筛选得到九个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆,并对其中的一个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆pGXN1009进行亚克隆,将β-葡萄糖苷酶基因定位在4.3kb的片段上。测序结果表明在4.3kb的片段上有一个全长为1956bp的ORF,编码一个可能的β-葡萄糖苷酶基因um-bgl3A,其编码产物与一个来源于小鼠大肠未培养细菌的β-葡萄糖苷酶(GenBankAcessionNO:AAX16378.1)一致性为63%、相似性为79%;与哈氏噬纤维菌(Cytophagahutchinsonii)的β-葡萄糖苷酶(GenBankAcessionNO:ZP-00308419)的一致性为50%、相似性为67%。利用SMART软件对Umbgl3A结构组件预测表明,Umbgl3A包含一个家族3糖基水解酶(glycosylhydrolase)功能域和一个家族3C糖基水解酶功能域。遗传进化分析表明umbgl3A基因可能是来自牛瘤胃微生物噬纤维菌属未培养的一个种。
引用
收藏
页码:472 / 476
页数:5
相关论文
共 4 条
[1]   瘤胃细菌、原虫和真菌降解植物细胞壁的相对贡献及其互作 [J].
高巍 ;
孟庆翔 .
中国农业大学学报, 2003, (05) :98-104
[2]   瘤胃微生物纤维素酶的研究与应用前景 [J].
蓝贤勇 ;
陈宏 ;
张润锋 ;
田燚 .
黄牛杂志, 2003, (02) :36-39
[3]   瘤胃微生物对纤维素降解机理 [J].
陈庆今 ;
刘焕彬 ;
胡勇有 .
微生物学杂志, 2002, (02) :44-46
[4]  
分子克隆实验指南[M]. 科学出版社[美]萨姆布鲁克(Sambrook,J·)等 著, 1992