有关细菌根部定殖测量的几个重要问题

在有益细菌与宿主植物的相互作用过程中,引入细菌能否在根部定殖至关重要。因此,测量细菌在根部定殖的水平已成为根圈微生物学研究的常规内容。但在测量细菌根部定殖时,必须首先给予根部定殖一个明确的概念和定义。真正意义上的根部定殖者是指那些在竞争性环境中(如自然田间土壤中)能在根部定殖的细菌。所以选择的模式检验系统应是非灭菌的。引入细菌的回收方法决定于实验目的。测量根外定殖、根内定殖或是全部,要求采用不同的取样方法和样品处理方式。要将引入菌株与土著根圈微生物区系中的同类成员区分开还必须有标记系统,自发抗生索抗性、免疫学方法、外源DNA顺序和各类标记基因均属于已在应用之中的标记系统,但每种方法各具优缺点。测量根部定殖的试验设计还需要注意几个统计学上的问题,如样本单位的组成、所测报圈定殖者群体数量的最佳表达方式、方差分析的基本条件、均值主算中"零值"的外理等。上述方法及其涉及的问题本文都作了介绍和讨论。