用4肽结构字预测蛋白质二级结构

被引:4
作者
冯永娥
罗辽复
机构
[1] 内蒙古大学物理科学与技术学院
关键词
蛋白质二级结构; 4肽结构字; 多样性增量; 二次判别法; 结构涨落; 边界修正; 长程关联;
D O I
暂无
中图分类号
Q51 [蛋白质];
学科分类号
070307 [化学生物学];
摘要
介绍一种新的方法来预测蛋白质二级结构.该方法是基于4肽结构字的基础上,利用4肽结构字建立多样性源同时结合二次判别法来预测一个序列片段中心残基的二级结构,最后对预测后的结果进行修正.对1645个蛋白进行检验,其21残基片段中心残基,10折交叉检验的结果Q3**(Q3score)达到79.68%.当考虑长程序列信息时,预测将会更精确.与其它预测软件相比较,显示了一定的优势.
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[1]
生物数学.[M].徐克学著;.科学出版社.1999,