医疗卫生事业财政投入绩效评价日益成为世界各国公共财政管理的重要内容。近年来,山东省医疗卫生事业财政投入规模逐步扩大,但财政投入绩效如何值得深入分析。本文运用DEA-Tobit两阶段法,对山东省医疗卫生事业财政投入绩效及其影响因素进行实证分析。研究发现,山东省医疗卫生事业财政投入绩效具有显著的地域差异性,2004-2005年效率值呈下降趋势,2006-2013年呈波动上升趋势;城镇化水平与医疗卫生财政投入绩效呈正相关关系,而人均GDP、医疗卫生事业财政投入相对比重则具有负向影响。基于此,优化医疗卫生投入结构、加大转移支付力度、提高医疗卫生经费的使用效率、从健康服务业的角度重视医疗卫生事业的发展就成为当前提高医疗卫生事业财政投入绩效的客观选择。