土壤可培养微生物的动态变化表明,低浓度井冈霉素对细菌总数没有明显影响,较高浓度井冈霉素可促进细菌总数的增加,其中浓度在60mL/kg时,井冈霉素对细菌的刺激强度最高,为对照的220倍,过高浓度的井冈霉素(240mL/kg)对细菌总量的促进作用反而不明显。井冈霉素对土壤中放线菌数量是先刺激后抑制,刺激强度最高时,放线菌数量可增至对照的61倍左右;而最高抑制强度可使放线菌的数量降至对照的14.5%。井冈霉素对真菌的敏感性较低,只有浓度高达120、240mL/kg时,才对真菌产生明显刺激作用,最高刺激强度为同时期对照的118倍。发光菌的毒理试验表明,低浓度井冈霉素毒性很低,较高浓度时呈现较大毒性,但能在短期内恢复,而过高浓度时的井冈霉素可能对土壤微生物造成不可恢复的影响。