学科是形而上的知识门类、形而下的组织建制和社会实践的统一体。学科治理是对大学治理的纵深推进。学科治理要以学科的知识体系属性、组织建制属性、实践属性为依据,确定学科治理的一系列规范,从而提高学科治理的有效性。我国学科治理的现实困境是:学科治理范围受限,学科治理主体权力缺失,学科治理制度不健全,学科治理文化的行政化和功利化取向。因此,应努力跨越学科壁垒,激发学科治理的内生动力;基于多元主体协商共治,促进学科治理结构的形成;加强学科组织建设,夯实学科治理的组织基础;基于学科的知识属性、组织属性与实践属性,培育民主自治开放的学科治理文化。