应用DGGE研究微生物群落时的常见问题分析

被引:74
作者
邢德峰
任南琪
机构
[1] 哈尔滨工业大学市政环境工程学院
基金
国家杰出青年科学基金;
关键词
DGGE; 微生物群落; 微生物分子生态学; 图谱分析; 排序;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2006.02.034
中图分类号
Q938 [微生物生态学和地区分布];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
变性梯度凝胶电泳(DGGE)是通过核酸片段对微生物群落进行研究,可以监测未培养细菌及其功能基因,被广泛地应用于微生物群落多样性和动态分析,并成为微生物分子生态学研究中的重要手段之一。文中论述了DGGE操作过程中遇到的常见问题,并提出了相应的解决方法。全面分析了样品预处理过程和PCR扩增效果对DGGE分析的影响,探讨了DGGE图谱的优化过程和图谱分析方法,并对DGGE的应用前景进行了综述。
引用
收藏
页码:331 / 335
页数:5
相关论文
共 6 条
[1]   DG-DGGE分析产氢发酵系统微生物群落动态及种群多样性 [J].
邢德峰 ;
任南琪 ;
宋业颖 ;
李秋波 ;
赵立华 ;
徐香玲 .
生态学报, 2005, (07) :1818-1823
[2]   DGGE/TGGE技术及其在微生物分子生态学中的应用 [J].
宫曼丽 ;
任南琪 ;
邢德峰 .
微生物学报, 2004, (06) :845-848
[3]   DNA银染的清除与重染附视频 [J].
陈涛 ;
刘欣 ;
曹海燕 ;
解用虹 .
生物化学与生物物理进展, 2000, (04) :437-437
[4]   Use of the ammonia-oxidizing bacterial-specific phylogenetic probe Nso1225 as a primer for fingerprint analysis of ammonia-oxidizer communities [J].
Calvó, L ;
Vila, X ;
Abella, CA ;
Garcia-Gil, LJ .
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2004, 63 (06) :715-721
[5]   Effect of organic mulches on soil bacterial communities one year after application [J].
Yang, YJ ;
Dungan, RS ;
Ibekwe, AM ;
Valenzuela-Solano, C ;
Crohn, DM ;
Crowley, DE .
BIOLOGY AND FERTILITY OF SOILS, 2003, 38 (05) :273-281
[6]  
Application of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in microbial ecology[J] . Gerard Muyzer,Kornelia Smalla.Antonie van Leeuwenhoek . 1998 (1)