Phaeocystis globosa与Phaeocystis antarctica叶绿体psbA基因的比较

测定了2株球形棕囊藻PhaeocystisglobosaP1、P2的 psbA基因序列 ,发现得到的2个序列完全相同。以P2序列对比分析了P.globosa和P.antarctica的psbA基因在DNA序列、氨基酸序列和RNA二级结构上的差异性 ,发现2种棕囊藻psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守 ,无插入/缺失 ,其核苷酸和氨基酸变异率分别为1.88 %和1.13 %。与核基因核苷酸的碱基替换不同 ,psbA基因核苷酸的碱基替换主要发生在密码子的第1位上 ,且不引起氨基酸的变化 ,引起氨基酸变化的碱基替换都发生在密码子的第2位和第3位上。在RNA二级结构上两序列的1～4茎环结构完全相同 ,表现出明显的棕囊藻属的特异性 ,其它结构区域差异较大 ,种间差异表现明显。由于 psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守 ,可能不适宜棕囊藻属的系统发育分析。但其RNA二级结构可能对于棕囊藻的分子分类有一定的参考价值。