亚麻EST序列中SSR标记的筛选

被引：19

作者：

张建平 ^{[1
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王斌 ^{[2
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赵丽娟 ^{[3
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王利民 ^{[1
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杨崇庆 ^{[2
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颉瑞霞 ^{[2
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党占海 ^{[1
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机构：

[1] 甘肃省农业科学院作物研究所

[2] 甘肃农业大学农学院

[3] 甘肃省农业科学院生物技术研究所

来源：

西北植物学报 | 2009年 / 29卷 / 05期

关键词：

亚麻; EST; SSR; 标记;

D O I：

暂无

中图分类号：

S563.2 [亚麻];

学科分类号：

摘要：

利用亚麻NCBI数据库中的7941条亚麻EST序列进行SSR的筛选,共发现222个SSR,占整个EST数据库的2.73%,其中三核苷酸重复单元的EST-SSR占总SSR的72.1%,二核苷酸和四核苷酸二者出现的频率基本相近,分别占总SSR的14.4%和13.5%.AGAA是四核苷酸中的优势重复类型,占四核苷酸重复类型的67.67%.设计的21对EST-SSR引物中有18对在10个亚麻材料中有扩增产物,占设计引物的85%,有14对产物条带比较清晰并具有多态性.基于SSR标记进行聚类分析,可将10个亚麻材料划分为3个组.本研究建立的亚麻SSR标记,为亚麻遗传多样性鉴定、分子作图等研究提供了一种有效的分子标记系统.

引用

页码：910 / 915

页数：6

共 13 条

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