基于偏相关系数网络模型的构建

被引:3
作者
闫艳 [1 ]
江成顺 [2 ]
机构
[1] 中南财经政法大学
[2] 长江师范学院
关键词
高斯图模型; 蛋白质间相互作用网络; 偏相关系数; PC-stable算法;
D O I
10.16813/j.cnki.cn35-1286/g4.2019.02.001
中图分类号
O157.5 [图论]; Q811.4 [生物信息论];
学科分类号
070101 [基础数学]; 090609 [兽医生物信息学];
摘要
在度量网络节点间的相关性时,偏相关系数因能区分直接相关性与间接相关性得到广泛的应用。高斯图模型是一种重要的无向图模型,然而当样本数目(n)小于变量数量(P)时不再适用。研究针对此类问题,讨论了改进的高斯图模型算法。在处理高维数据时,提出了基于偏相关系数的路径相容稳定(PC-stable)算法,通过与改进的高斯图模型算法进行实验模拟对比,显示所提出的新算法,即基于PC-stable的偏相关系数算法构建的网络具有更高的精度。最后运用所提出的算法构建了一个生物网络,并对网络进行说明。
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[2]
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Tenenhaus, Arthur ;
Guillemot, Vincent ;
Gidrol, Xavier ;
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IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2010, 7 (02) :251-262
[3]
Sparse partial least squares regression for simultaneous dimension reduction and variable selection.[J]..Journal of the Royal Statistical Society: Series B (Statistical Methodology).2010, 1
[4]
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Yuan, Ming ;
Lin, Yi .
BIOMETRIKA, 2007, 94 (01) :19-35
[5]
The adaptive lasso and its oracle properties [J].
Zou, Hui .
JOURNAL OF THE AMERICAN STATISTICAL ASSOCIATION, 2006, 101 (476) :1418-1429