水霉菌总DNA提取方法研究

被引:9
作者
可小丽 [1 ]
汪建国 [1 ]
顾泽茂 [2 ]
李明 [1 ]
龚小宁 [1 ]
机构
[1] 中国科学院水生生物研究所
[2] 华中农业大学水产学院
关键词
水霉菌; DNA提取; 溶菌酶; 十六烷基三甲基溴化铵(CTAB); 尿素; 十二烷基硫酸钠(SDS);
D O I
暂无
中图分类号
S941 [鱼病学];
学科分类号
摘要
本实验采用EP管反复冻融和研磨的破壁方式,利用溶菌酶法、CTAB法、改良CTAB法、尿素法、十二烷基硫酸钠(SDS)法等5种方法,分别对5种鱼类致病性水霉菌(寄生水霉、多子水霉、异株水霉及两未定种)的基因组DNA进行提取,并采用紫外分光光度计和ITS区基因(包括5.8SrDNA)PCR扩增对DNA进行了评价。紫外分光光度计检测结果表明,5种方法均可提取到水霉菌DNA,其中改良CTAB法提取的5种水霉菌的DNA产量和质量最高,A260/A280在1.79—1.82之间,浓度为45μg/mL;PCR检测结果表明,只有改良CTAB法提取的DNA全部扩增到明亮、整齐、无拖尾的特异性条带,其他几种方法均存在暗带或无带现象。因此,改良CTAB法可以作为水霉菌DNA提取以开展分子生物学研究的首选方法。
引用
收藏
页码:68 / 73
页数:6
相关论文
共 20 条
  • [1] Characterisation of Saprolegniasp.isolates fromchannel catfish. Bangyeekhun E,Quiniou S MA,BlyJ E,et al. Diseases of Aquatic Organisms . 2001
  • [2] Taxonomic and phylogenetic anal-ysisi ofsaprolegnialeae[oomycetes]inferredfromLSUrDNAandITS sequence comparisons. Leclerc MC,Guillot J,Deville M. Antonie van Leeuwenhoek . 2000
  • [3] Mass mortality in cultured coho salmon (Oncorhynchus kisutch) due to Saprolegnia parasitica Coker. Hatai K. Journal of Wildlife Management . 1992
  • [4] 角膜炎常见致病真菌DNA快速提取方法的探索
    杨潇远
    王丽娅
    李振勇
    李智涛
    屈超义
    孙声桃
    不详
    [J]. 中华检验医学杂志 , 2005, (09) : 86 - 86
  • [5] 致病性真菌DNA提取方法的实验研究
    陈官芝
    徐秀莲
    吴延芳
    王云
    罗兵
    [J]. 中华皮肤科杂志, 2002, (05) : 78 - 79
  • [6] 简便易行的丝状真菌染色体DNA提取法
    吴志红
    汪天虹
    黄卫
    曲音波
    [J]. 菌物系统, 2001, (04) : 575 - 577
  • [7] 花鲈水霉病及其病原的初步研究
    李爱华
    聂品
    卢全章
    [J]. 水生生物学报, 1999, (04) : 388 - 390
  • [8] 玉米RAPD程序优化研究及其初步探讨
    傅骏骅
    李连城
    刘新芝
    彭泽斌
    黄长玲
    [J]. 作物学报, 1997, (01) : 56 - 61
  • [9] Saprolegnia multispora , a new oomycete isolated from water samples taken in a river in the Burgundian region of France[J] . Bernard Paul,Mónica M. Steciow. &nbspFEMS Microbiology Letters . 2004 (2)
  • [10] Taxonomic and phylogenetic analysis of Saprolegniaceae (Oomycetes) inferred from LSU rDNA and ITS sequence comparisons
    Leclerc, MC
    Guillot, J
    Deville, M
    [J]. ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, 2000, 77 (04): : 369 - 377