单管-套式/多重聚合酶链反应在间日疟原虫基因型鉴定中的价值附视频

被引:5
作者
黄天谊
黎学铭
刘涛
郭传坤
黄雨婷
林睿
机构
[1] 贵州省疾病预防控制中心慢性病防治研究所
[2] 南宁市广西壮族自治区疾病预防控制中心
[3] 南宁市广西壮族自治区疾病预防控制中心 贵阳
[4] 贵阳
关键词
疟原虫,间日; 聚合酶链反应; 基因型; 多态性,单核苷酸;
D O I
暂无
中图分类号
R446.9 [其他];
学科分类号
100208 ;
摘要
目的 对单管 套式多重聚合酶链反应 (PCR)鉴定间日疟原虫基因型方法的应用价值进行研究。方法 以间日疟原虫环子孢子蛋白 (CSP)基因为模型 ,综合套式多重PCR、等位特异PCR和标签引物扩增等技术 ,使用PrimerPremier 5 0软件和NCBI的BLAST网络改进与优化引物设计 ,并用矩阵试验法优化反应条件和程序 ,同时 ,用单管 套式多重PCR和套式PCR对 71份间日疟患者血标本的间日疟原虫基因型鉴定结果作比较。结果 单管 套式多重PCR可同时扩增出 3种不同长度的基因型 /族特异片段 ,且基本消除了二聚体等噪音。用单管 套式多重PCR鉴定检测 71份间日疟患者血标本 ,6 2份与套式PCR鉴定结果一致 ,并新发现 6份不同基因型和PV Ⅱ型的混合感染 ;还将 2份套式PCR鉴定为热带族的血标本纠正为PV Ⅱ型 ,1份阴性血样鉴定为温带族。结论 研究建立的单管 套式 /多重PCR鉴定间日疟原虫基因型的方法 ,简化了试验步骤 ,节省了试剂耗材 ,消除了PCR噪音 ,提高了检出间日疟原虫混合感染和低度感染的敏感性 ;是一种具有发展潜力的检测单核苷酸多态性和基因型鉴定的方法
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