1个油茶Y2SK2型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测

被引：19

作者：

胡孝义

谭晓风

张党权

曾艳铃

陈鸿鹏

田晓明

刘巧

机构：

[1] 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室

来源：

林业科学 | 2008年 / 10期

关键词：

油茶; 脱水素基因; cDNA文库; RACE; 生理功能; 生物信息学;

D O I：

暂无

中图分类号：

S794.4 [油茶];

学科分类号：

090702 [森林培育];

摘要：

以构建的油茶EST文库为基础,采用电子克隆技术,分离克隆一个脱水素基因的全长cDNA序列,该基因的cDNA全长1406bp,含一个600bp的CDS,编码200aa的小分子蛋白。推测该基因编码蛋白的分子质量为21ku,等电点7,暂命名为CoDHNI。同源性分析发现该基因的编码蛋白具有2个Y-片段(DEYGNP),1个S-片段(SGSSSSSS),2个K-片段(KIKEKLPG),属于典型的Y2SK2型脱水素。经Blast比对,发现富含苏氨酸的Thr-区在各物种间变异显著,推测该区为油茶所特有,有利于在被保护的大分子表面形成水合层;同时还发现一个十分保守的基序:EDDGQGGRRKK,可能有利于脱水素的磷酸化和亚细胞定位。通过与柑桔和拟南芥的脱水素比较,提出CoDHNI有可能缓冲种子脱水胁迫响应时钙离子的瞬时增高,并可结合重金属离子,以减轻活性氧的危害。

引用

页码：55 / 62

页数：8

共 11 条

[1]

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Deng, Zhongxiang ;

Wang, Yiding ;

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