宫颈癌淋巴结转移相关基因的表达谱研究

被引:2
作者
朱秀兰 [1 ]
马文丽 [1 ]
阴常欣 [1 ]
郑文岭 [1 ,2 ]
机构
[1] 南方医科大学基因工程研究所
[2] 华南基因组中心
关键词
宫颈癌; 淋巴转移; 基因芯片; 差异表达;
D O I
10.16605/j.cnki.1007-7847.2009.04.015
中图分类号
R737.33 [子宫肿瘤];
学科分类号
100112 [医学生物化学与分子生物学];
摘要
淋巴结转移是影响宫颈癌预后因素的首要因素,但分子机理尚不清楚,探讨宫颈癌淋巴结转移的分子机制,筛选可能用于临床诊断和治疗的新的分子靶标尤其重要.BRB-Array Tools软件对基因表达综合数据库(Gene Expression Ominibus,GEO)中有/无淋巴结转移早期宫颈癌的基因芯片表达谱数据进行统计学分析,找出二者的差异基因,利用GenCLip软件进行文献挖掘研究这些差异表达基因的功能关系.筛选出71个差异表达基因,其中35个在有淋巴转移的宫颈癌中表达上调,36个下调.文献挖掘发现FZD10、PDZK1IP1、SERPINB9、COMP、MAGEA1等几个新的宫颈癌淋巴转移相关基因.结果表明生物信息学方法能有效地分析基因芯片数据并获取生物内在信息,为宫颈癌淋巴转移发生机制及治疗靶位开辟新思路.
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