转录组与RNA-Seq技术

被引：62

作者：

张春兰 ^{[1
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秦孜娟 ^{[2
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王桂芝 ^{[2
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纪志宾 ^{[2
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王建民 ^{[2
]}

机构：

[1] 潍坊学院生物与农业工程学院

[2] 山东农业大学动物科技学院

来源：

生物技术通报 | 2012年 / 12期

关键词：

转录组; RNA-Seq; 新一代测序技术;

D O I：

10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2012.12.025

中图分类号：

Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

转录组是特定细胞或组织在特定时间或状态下转录出来的所有RNA的集合。通过对转录组的研究可以揭示生物体的基因表达、研究结构变异及发现新基因等。转录组分析的研究方法、研究平台发生着日新月异的变化,同时生物信息学分析的内容也在逐渐完善。RNA-Seq作为一种新的转录组研究手段,利用新一代测序技术能够更为快速、准确地为人们提供更多的生物体转录信息。主要比较近年来转录组研究的几种方法和几种RNA-Seq的研究平台,并着重介绍RNA-Seq的原理、用途、步骤和生物信息学分析等及在相关领域的应用等内容,为相关的研究和应用提供参考。

引用

页码：51 / 56

页数：6

共 11 条

[1]

新一代测序技术在植物转录组研究中的应用[J]. 梁烨,陈双燕,刘公社.遗传. 2011(12)

[2]

A MicroRNA Catalog of Swine Umbilical Vein Endothelial Cells Identified by Deep Sequencing[J]. DAI Chen,ZHANG Yan-ming,ZHANG Qian,WU Zong-song,DENG Wen,ZHANG Xu,GUO Kang-kang,TANG Qing-hai and HOU Bo College of Veterinary Medicine,Northwest A＆F University,Yangling 712100,P.R.China.Agricultural Sciences in China. 2011(09)

[3]

转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用[J]. 祁云霞,刘永斌,荣威恒.遗传. 2011(11)

[4]

猪脂肪沉积关键基因筛选及TCTP基因功能研究[D]. 李新建.西北农林科技大学 2011

[5]

基于RNA-Seq技术的米曲霉RIB40转录组学研究[D]. 王斌.华南理工大学 2010

[6] Identification of long non-protein coding RNAs in chicken skeletal muscle using next generation sequencing [J].

Li, Tingting ;

Wang, Suya ;

Wu, Rimao ;

Zhou, Xueya ;

Zhu, Dahai ;

Zhang, Yong .

GENOMICS, 2012, 99 (05) :292-298

[7] Observations on novel splice junctions from RNA sequencing data [J].

Wang, Likun ;

Wang, Xiaowo ;

Wang, Xi ;

Liang, Yanchun ;

Zhang, Xuegong .

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2011, 409 (02) :299-303

[8]

SNP discovery in the bovine milk transcriptome using RNA-Seq technology[J] . Angela Cánovas,Gonzalo Rincon,Alma Islas-Trejo,Saumya Wickramasinghe,Juan F. Medrano.Mammalian Genome . 2010 (11)

[9]

Uncovering the Complexity of Transcriptomes with RNA-Seq[J] . Valerio Costa,Claudia Angelini,Italia De Feis,Alfredo Ciccodicola,Momiao Xiong.Journal of Biomedicine and Biotechnology . 2010

[10]

Comparison of transcriptomic landscapes of bovine embryos using RNA-Seq. Huang W,Hasan Khatib. BMC Genetics . 2010

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