一种新的氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用

被引：20

作者：

梅虎

周原

孙立力

李志良

机构：

[1] 重庆大学化学化工学院,重庆大学化学化工学院,生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆大学化学化工学院生物医学工程教育部与重庆市重点实验室,重庆大学生物工程学院重庆,生物医学工程教育部与重庆市重点实验室重庆,重庆大学生物工程学院重庆,生物医学工程教育部与重庆市重点实验室重庆

来源：

物理化学学报 | 2004年 / 08期

关键词：

氨基酸; 多肽; 拓扑; VSTV; 定量构效关系; 偏最小二乘回归;

D O I：

暂无

中图分类号：

O621 [有机化学一般性问题];

学科分类号：

070303 ; 081704 ;

摘要：

从天然氨基酸的25个结构与拓扑变量中经主成分分析得到一种新的氨基酸描述子———VSTV(principalcomponentscoresvectorofstructuralandtopologicalvariables).应用该描述子对以下3个体系,即血管紧张素转化酶抑制剂(2肽)、抗菌18肽和促凝血酶原激酶抑制剂(6～12肽)进行分子结构参数化表达,并在此基础上通过偏最小二乘回归(PLSR)建立定量构效关系(QSAR)模型,取得了优于文献的结果.模型的复相关系数(R2)和交互检验复相关系数(Q2)分别为0.789,0.767;0.996,0.879;0.981,0.480.

引用

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