草鱼胞质苹果酸脱氢酶(cMDH)的序列克隆及分析

被引:5
作者
朱文漓 [1 ]
顾继锐 [1 ]
辜文博 [1 ]
吴江 [2 ]
刘汉元 [2 ]
徐恒 [1 ]
机构
[1] 生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院
[2] 通威股份有限公司
关键词
草鱼(Ctenopharyngodon idellus); 肠道; 胞质苹果酸脱氢酶; cDNA; 克隆; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
0908 ;
摘要
以实验室构建的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道cDNA文库苹果酸脱氢酶(cMDH)EST序列为基础,采用末端快速扩增法(RACE),从健康雌性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道细胞RNA中获得1391 bp的草鱼肠道cMDH的cDNA序列(NCBI登录号:EU569765)。结果显示:该序列包含62 bp的5′非编码区(5′-UTR),330 bp的3′非编码区(3′-UTR),典型加尾信号AATAA位于polyA起点上游16 bp。开放阅读框ORF长999 bp,共编码333个氨基酸,预测蛋白等电点为6.67,大小为36 kDa。多序列比对显示草鱼胞质苹果酸脱氢酶具有典型的苹果酸脱氢酶功能区保守序列,该酶与斑马鱼cMDH相似度最高达到95.5%,与模式植物拟兰介的相似度为57.8%,其预测三级结构具有典型cMDH功能区。Southern杂交结果表明草鱼cMDH属于多拷贝基因家族。
引用
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页数:7
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