基于核磁共振的代谢组学数据预处理

被引：26

作者：

温锦波 ^{[1
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杨叔禹 ^{[2
]}

肖娴 ^{[1
]}

董继扬 ^{[1
]}

李学军 ^{[2
]}

陈忠 ^{[1
]}

机构：

[1] 厦门大学物理学系

[2] 厦门市第一医院

来源：

厦门大学学报(自然科学版) | 2007年 / 06期

关键词：

代谢组学; 预处理; 归一化; 变量选择;

D O I：

暂无

中图分类号：

R445.2 [核磁共振成像];

学科分类号：

100231 [临床病理学];

摘要：

数据归一化是预处理中的重要组成部分,本文采用正常大鼠与I型糖尿病模型大鼠的尿液核磁共振谱图作为测试数据,研究了线归一、面归一和模归一3种数据预处理方法对代谢组学数据PCA分析结果的影响.分析结果表明,面归一预处理方法能够更好地在PC得分图上将对照组和糖尿病组的样本分开.此外,为了有选择性的去除代谢组学数据组中的噪声变量,本文引入新的参数R来评估PC得分图的分类效果,并把它引入适应度函数,设计相应的遗传算法,对代谢组学数据进行变量选择.经过变量选择后,主成分得分图上不同类别样本的可分性提高了,而且变量数大大地减少,更有利于特征代谢物的标记与识别.

引用

页码：783 / 787

页数：5

共 5 条

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