DNA条形码识别 Ⅲ.媒介蚊类DNA条形码芯片的初步研究

被引：25

作者：

赵明 ^{[1
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谭玲 ^{[2
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莫帮辉 ^{[3
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刘伟 ^{[2
]}

王仕应 ^{[2
]}

曾晓茂 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国科学院成都生物研究所

[2] 四川出入境检验检疫局

[3] 中国科学院成都计算机应用研究所

来源：

中国媒介生物学及控制杂志 | 2008年 / 02期

关键词：

COⅠ基因; DNA条形码; DNA芯片; 蚊虫;

D O I：

暂无

中图分类号：

R384.1 [蚊、白蛉];

学科分类号：

摘要：

目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交30个样本,应用软件Bio-Edit计算属、种及种内个体间的同一性,应用phylip3.66软件以最大简约法分别对杂交结果和原序列进行聚类分析比较。结果选择78个DNA片段制作一张虚拟DNA条形码芯片,计算属间的平均同一性为0.75,同一属内种间的平均同一性为0.84,种内个体间的平均同一性为0.98,聚类分析结果一致。结论研制的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的15种蚊虫,利用DNA条形码信息,设计DNA芯片在理论上可行。

引用

页码：99 / 103

页数：5

共 6 条

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