猪瘟病毒石门系强毒株及兔化弱毒疫苗株(HCLV株)是我国的标准毒株,囊膜糖蛋白gp55(又称E1)是该病毒最重要的保护性抗原。本实验采用反转录PCR扩增了这两个毒株的gp55基因。序列分析结果表明:1.石门株和兔化弱毒株糖蛋白E1的氨基酸序列含有15个半胱氨酸残基(Cys),其数量及位置与国外4株猪瘟病毒(Alfort、Brescia、ALD和GPE-)完全一样。E1中Cys的数量及位置的保守性说明,该病毒这一保护性抗原在各毒株之间具有相同的骨架结构。2.E1糖蛋白N端的信号肽序列及C端的跨膜区序列是比较保守的,然而位于N端的抗原区序列是非保守的,其中氨基酸变异较大的区域大约在702~742氨基酸残基之间。3.所测得的HCLV株E1的氨基酸序列,与国外测得的HCLV株E1的氨基酸序列有明显差异,这一差异均一地分布于整个E1序列。因此,推测国内外同出一宗的HCLV疫苗株,在长期的使用传代过程中发生了一定程度的遗传变异。