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海南三种野生稻遗传多样性的比较研究
被引:30
作者
:
孙希平
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机构:
山西农业大学生物工程中心
山西农业大学生物工程中心
孙希平
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杨庆文
[
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李润植
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王效宁
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海南省农业科学院水稻研究所
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王效宁
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机构
:
[1]
山西农业大学生物工程中心
[2]
中国农业科学院作物科学研究所
[3]
海南省农业科学院水稻研究所
来源
:
作物学报
|
2007年
/ 07期
基金
:
海南省自然科学基金;
关键词
:
普通野生稻;
疣粒野生稻;
药用野生稻;
SSR;
遗传多样性;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
S511.9 [野生稻];
学科分类号
:
090105
[作物生产系统与生态工程]
;
摘要
:
利用39对SSR引物对海南114份普通野生稻、146份疣粒野生稻和81份药用野生稻进行扩增,从多态位点比率、平均等位基因数、香农指数等多个指标比较了3种野生稻遗传多样性的差异。结果表明,普通野生稻的遗传多样性最高,疣粒野生稻次之;在所检测的53个位点中,药用野生稻和疣粒野生稻的多态位点数分别为普通野生稻的1/7和2/7,等位基因数分别为普通野生稻的37%和39%;平均每个位点的实际杂合度,以普通野生稻杂合度最高(60%),分别是疣粒野生稻和药用野生稻的4.6倍和6.6倍。Wright-统计量和聚类分析结果表明,普通野生稻群体的遗传多样性主要来自群间,当遗传一致度I等于0.53时,3个居群分别属于不同类群,因此建议将3个普通野生稻居群都纳入原生境保护点建设范围。同时,药用野生稻和疣粒野生稻无论居群间还是居群内遗传变异都很小,各居群个体间出现部分交叉,只有当I大于0.9时才分别聚为不同的类群,因此,在进行原生境保护时只需保护遗传多样性水平高的居群即可。
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共 15 条
[1]
Genetic diversity in the northernmost Oryza rufipogon populations estimated by SSR markers
[J].
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Song, ZP
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Xu, X
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Fudan Univ, Inst Biodivers Sci, Minist Educ Key Lab Biodivers Sci & Ecol Engn, Shanghai 200433, Peoples R China
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Xu, X
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Wang, B
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Wang, B
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Chen, JK
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Fudan Univ, Inst Biodivers Sci, Minist Educ Key Lab Biodivers Sci & Ecol Engn, Shanghai 200433, Peoples R China
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Chen, JK
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Lu, BR
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Fudan Univ, Inst Biodivers Sci, Minist Educ Key Lab Biodivers Sci & Ecol Engn, Shanghai 200433, Peoples R China
Fudan Univ, Inst Biodivers Sci, Minist Educ Key Lab Biodivers Sci & Ecol Engn, Shanghai 200433, Peoples R China
Lu, BR
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THEORETICAL AND APPLIED GENETICS,
2003,
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(08)
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[2]
Genetic variation within and among populations of a wild rice Oryza granulata from China detected by RAPD and ISSR markers
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Qian, W
;
Ge, S
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Chinese Acad Sci, Inst Bot, Lab Systemat & Evolutionary Bot, Beijing 100093, Peoples R China
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Ge, S
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Hong, DY
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Chinese Acad Sci, Inst Bot, Lab Systemat & Evolutionary Bot, Beijing 100093, Peoples R China
Chinese Acad Sci, Inst Bot, Lab Systemat & Evolutionary Bot, Beijing 100093, Peoples R China
Hong, DY
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THEORETICAL AND APPLIED GENETICS,
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The extinction of genetic resources of Asian wild rice, Oryza rufipogon Griff.:: A case study in Thailand
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Akimoto, M
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Hokkaido Univ, Fac Agr, Sapporo, Hokkaido 0608589, Japan
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Akimoto, M
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Shimamoto, Y
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Shimamoto, Y
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Morishima, H
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Hokkaido Univ, Fac Agr, Sapporo, Hokkaido 0608589, Japan
Morishima, H
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GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION,
1999,
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(04)
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The use of RAPD markers to facilitate the identification of Oryza species within a germplasm collection
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Martin, C
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Juliano, A
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Juliano, A
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Jackson, MT
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FordLloyd, BV
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GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION,
1997,
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(02)
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GENETIC ANALYSES OF ORYZA SPECIES BY MOLECULAR MARKERS FOR CHLOROPLAST GENOMES
[J].
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ICHIKAWA, H
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HIRAI, A
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HIRAI, A
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NAGOYA UNIV,FAC AGR,GRAD DIV BIOCHEM REGULAT,NAGOYA,AICHI 464,JAPAN
KATAYAMA, T
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THEORETICAL AND APPLIED GENETICS,
1986,
72
(03)
:353
-358
[7]
DIFFERENTIATION OF PERENNIAL AND ANNUAL TYPES DUE TO HABITAT CONDITIONS IN THE WILD RICE ORYZA-PERENNIS
[J].
MORISHIMA, H
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MORISHIMA, H
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1984,
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[8]
原、异位保存普通野生稻种质资源的遗传多样性比较研究
[J].
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杨庆文
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余丽琴
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苗晗
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苗晗
.
中国农业科学,
2005,
(06)
:1073
-1079
[9]
桂东南地区普通野生稻遗传多样性研究
[J].
任民
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四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
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陈成斌
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杨庆文
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四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
杨庆文
.
植物遗传资源学报,
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(01)
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[10]
云南元江普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)遗传多样性分析及保护策略研究
[J].
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戴陆园
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时津霞
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苗晗
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植物遗传资源学报,
2004,
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[1]
Genetic diversity in the northernmost Oryza rufipogon populations estimated by SSR markers
[J].
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Song, ZP
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Xu, X
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Fudan Univ, Inst Biodivers Sci, Minist Educ Key Lab Biodivers Sci & Ecol Engn, Shanghai 200433, Peoples R China
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Lu, BR
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Genetic variation within and among populations of a wild rice Oryza granulata from China detected by RAPD and ISSR markers
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Qian, W
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Ge, S
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Ge, S
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Hong, DY
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Chinese Acad Sci, Inst Bot, Lab Systemat & Evolutionary Bot, Beijing 100093, Peoples R China
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Hong, DY
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THEORETICAL AND APPLIED GENETICS,
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The extinction of genetic resources of Asian wild rice, Oryza rufipogon Griff.:: A case study in Thailand
[J].
Akimoto, M
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Hokkaido Univ, Fac Agr, Sapporo, Hokkaido 0608589, Japan
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Akimoto, M
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Shimamoto, Y
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Hokkaido Univ, Fac Agr, Sapporo, Hokkaido 0608589, Japan
Morishima, H
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GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION,
1999,
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The use of RAPD markers to facilitate the identification of Oryza species within a germplasm collection
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GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION,
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Abundance; polymorphism and genetic mapping of microsatellites in rice.[J].Kun-Sheng Wu;Steven D. Tanksley.MGG Molecular & General Genetics.1993, 1
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GENETIC ANALYSES OF ORYZA SPECIES BY MOLECULAR MARKERS FOR CHLOROPLAST GENOMES
[J].
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THEORETICAL AND APPLIED GENETICS,
1986,
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[7]
DIFFERENTIATION OF PERENNIAL AND ANNUAL TYPES DUE TO HABITAT CONDITIONS IN THE WILD RICE ORYZA-PERENNIS
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MORISHIMA, H
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OKA, HI
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PLANT SYSTEMATICS AND EVOLUTION,
1984,
144
(02)
:119
-135
[8]
原、异位保存普通野生稻种质资源的遗传多样性比较研究
[J].
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机构:
中国农业科学院作物品种资源研究所,江西省农业科学院水稻研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,江西省农业科学院水稻研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,南昌,北京,南昌,北京,北京,北京
时津霞
;
任军方
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
中国农业科学院作物品种资源研究所,江西省农业科学院水稻研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,江西省农业科学院水稻研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,南昌,北京,南昌,北京,北京,北京
任军方
;
苗晗
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
中国农业科学院作物品种资源研究所,江西省农业科学院水稻研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,江西省农业科学院水稻研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,南昌,北京,南昌,北京,北京,北京
苗晗
.
中国农业科学,
2005,
(06)
:1073
-1079
[9]
桂东南地区普通野生稻遗传多样性研究
[J].
任民
论文数:
0
引用数:
0
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0
机构:
四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
任民
;
陈成斌
论文数:
0
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0
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0
机构:
四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
陈成斌
;
论文数:
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机构:
荣廷昭
;
张万霞
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0
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0
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机构:
四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
张万霞
;
盖红梅
论文数:
0
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0
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0
机构:
四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
盖红梅
;
杨庆文
论文数:
0
引用数:
0
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0
机构:
四川农业大学玉米研究所,广西农业科学院水稻所,四川农业大学玉米研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所雅安中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,南宁,雅安,北京,北京山东农业大学农学院,泰安,北京博士副研究员
杨庆文
.
植物遗传资源学报,
2005,
(01)
:31
-36+42
[10]
云南元江普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)遗传多样性分析及保护策略研究
[J].
论文数:
引用数:
h-index:
机构:
杨庆文
;
戴陆园
论文数:
0
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0
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0
机构:
中国农业大学作物与生物技术学院,云南省农业科学院品资站,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,昆明,北京,北京,北京,北京
戴陆园
;
时津霞
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
中国农业大学作物与生物技术学院,云南省农业科学院品资站,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,昆明,北京,北京,北京,北京
时津霞
;
论文数:
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机构:
张万霞
;
任军方
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
中国农业大学作物与生物技术学院,云南省农业科学院品资站,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,昆明,北京,北京,北京,北京
任军方
;
苗晗
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
中国农业大学作物与生物技术学院,云南省农业科学院品资站,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所,中国农业科学院作物品种资源研究所北京,中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,昆明,北京,北京,北京,北京
苗晗
.
植物遗传资源学报,
2004,
(01)
:1
-5
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