长牡蛎(Crassostrea gigas)微卫星克隆快速分离及特性分析

被引:36
作者
李琪
木岛明博
不详
机构
[1] 中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
[2] 日本东北大学农学部 青岛
[3] 仙台
基金
教育部留学回国人员科研启动基金;
关键词
长牡蛎; 微卫星; 快速分离; 特性分析;
D O I
暂无
中图分类号
Q75 [分子遗传学];
学科分类号
071007 ;
摘要
采用磁珠杂交选择和PCR筛选法 ,从长牡蛎DNA选择片段文库中 ,快速分离含有微卫星序列的阳性克隆。结果表明 ,在筛选的 2 0 0个白色菌落中 ,5 6个克隆含有重复次数 5以上的微卫星序列 ,其中 41个 ( 2 0 5 % )有随机侧翼区 ,可以进行引物设计 ,1 2个缺乏足够的侧翼序列 ,3个为中断的微卫星序列。此外 ,还获得两个小卫星克隆。在获得的微卫星序列中 ,完全的占 5 4 7% ,不完全的占 2 0 8% ,复合的占 2 4 5 %。除探针中使用的CA重复单元外 ,还观察到CT、ACT、CGCA、CACT、GACT、GCAC、CCTTA和CCTCA的重复序列。微卫星重复次数主要集中在 5— 30次之间 ,占 71 7% ,最高为 60次。本研究中构建的长牡蛎 (CA) n 富集微卫星文库将为以后开发未知微卫星标记提供帮助
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