肝癌易感性相关基因的文献计量学与生物信息学分析

被引：13

作者：

上官辉 ^{[1
]}

谭淑燕 ^{[2
]}

张积仁 ^{[3
]}

机构：

[1] 南方医科大学附属佛山医院肿瘤内科

[2] 南方医科大学附属佛山医院肝病科

[3] 南方医科大学附属珠江医院肿瘤中心

来源：

中华肿瘤防治杂志 | 2015年 / 22卷 / 04期

关键词：

肝癌; 易感基因; 关键基因; 生物信息学;

D O I：

10.16073/j.cnki.cjcpt.2015.04.014

中图分类号：

R735.7 [肝肿瘤];

学科分类号：

100112 [医学生物化学与分子生物学];

摘要：

目的汇总分析肝癌易感基因研究文献,并通过生物信息学方法筛选关键基因,为进一步的研究提供参考。方法检索Embase、Pubmed和BIOSIS Preview 3大文献数据库2001-01-2014-01相关文献,基于文献挖掘的方法统计肝癌易感基因,使用生物信息学方法对于易感基因进行分析。结果纳入相关文献共708篇,研究显示近3年论文发表增长明显。文献涉及201个基因,其中不同分级的基因本体论(Gene Ontology,GO)分类741种,京都基因与基因组百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路66种,这些基因主要与细胞损伤修复、免疫反应、细胞周期调节、炎症反应、DNA损伤修复、凋亡和抗原递呈等有关。KEGG通路主要是参与细胞受体信号传导通路、细胞周期调节、毒物降解、氨基酸和脂肪酸代谢等。在线STRING软件构建其中189个可翻译成蛋白的蛋白与蛋白相互作用网络图,提示这些基因的表达产物大部分存在密切的相互作用关系。进一步运用Cytoscape软件将STRING软件所构建的蛋白网络图可视化及量化,筛选出11个关键基因。结论通过对肝癌易感基因相关文献的文献计量学分析,对该研究领域的研究现状及发展趋势有了系统的认识。肝癌易感性相关基因种类繁多,针对关键基因的大样本研究及网络化的基因分析是未来的研究方向。

引用

页码：305 / 311

页数：7

共 8 条

[1]

类固醇受体共激活因子-3在人肝癌组织中的表达及其临床意义 [J].