西南天山碰撞造山带由塔里木板块与中天山岛弧于海西晚期碰撞而成。在这一碰撞造山过程中,中天山岛弧逆冲到塔里木大陆板块北缘之上。穆龙套型金矿是一种与碰撞造山作用有关的韧性剪切带型金矿,它在碰撞造山过程中形成于缝合带的韧性剪切带中。在西南天山,它的主要成矿时代为印支期。中天山岛弧上的主要金矿类型为与岛弧的形成和演化有关的金矿,形成于海西期。根据我们对西南天山区域大地构造格局和穆龙套型金矿成因类型的认识,研究区可分为两大成矿区:科克苏成矿区和伊犁成矿区。前者为穆龙套型金矿成矿区,后者是与岛弧的形成和发展有关的金矿成矿区。