应用基因芯片技术对系统性红斑狼疮患者外周血基因表达谱的初步研究

被引:10
作者
韩光明
叶霜
沈南
陈顺乐
鲍春德
顾越英
王元
钱捷
机构
[1] 上海第二医科大学附属仁济医院风湿科上海市风湿病研究所
[2] 上海第二医科大学附属仁济医院风湿科上海市风湿病研究所 现在南京市第一医院风湿科
基金
国家自然科学基金重点项目;
关键词
红斑狼疮,系统性; 寡核苷酸序列分析; 基因表达;
D O I
暂无
中图分类号
R593.241 [];
学科分类号
摘要
目的 研究系统性红斑狼疮 (SLE)患者与正常对照外周血的基因表达谱的改变 ,以探讨SLE发病机制、诊断及鉴别诊断 ,以及基因功能的研究。方法 首先从外周血提取总RNA ,反转录合成单链、双链cDNA后 ,体外转录合成生物素标记的cRNA与基因芯片进行杂交 ,再通过抗原抗体反应机制标记上荧光染料Cy3后 ,使用基因芯片扫描仪进行图像扫描。使用分析软件进行表达差异和聚类分析。结果 在 30 0 0多个基因点中 ,与正常对照相比较 ,鉴定出 94个基因存在表达差异相关基因 ,其中有 33个基因表达上调 ,6 1个基因表达下调。这些表达差异基因有细胞因子及受体、转录相关基因、凋亡相关基因、生长分化相关基因、信号转导相关基因、细胞周期相关基因、电子传递和氧化相关基因、转移酶相关基因、核酸酶相关基因等。聚类分析结果显示不同的疾病以及不同临床表现的同一疾病其外周血的基因表达谱是有差异的 ,可以用于疾病的诊断和鉴别诊断。基因聚类发现 ,根据表达谱聚类在一起的基因存在功能上的相似性 ,可以用来发现已知基因的免疫相关功能。结论 该基因芯片技术方法有较高的重复性和稳定性 ,能有效地进行SLE致病基因的筛选 ,更好地理解SLE发生的分子机制、诊断及鉴别诊断 ,以及基因功能的研究。
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页码:392 / 396+476 +476
页数:6
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