对目前已发表下毛目纤毛虫的200个属级阶元进行了重新修订。给出新修订的下毛目系统,并根据其纤毛图式和形态发生特点将其归为5亚目20科82属。原下毛亚目Protohy potrichinasubordernov.,翁柯虫科Onychodromusidaefam.nov.,腹柱虫科Gastrostylidaefam.nov.和拟角毛虫属Parakeronopsisgen.nov.为新设,给出了下毛目中各亚目和科的特征简述及亚目及科的检索表。各属的特征以特征简述、检索表以及属的模式图的形式介绍之。新立原下毛亚目Protohypotrichinasubordernov.,并对排毛亚目Stichotrichina中的科属进行了重新修订。原下毛亚目的特征为无明确缘棘毛分化;排毛亚目的特征为无明确额-腹-横棘毛分化,腹棘毛为长的纵列,数目多,形式多样。修订后的原下毛亚目含2科3属,排毛亚目含5科29属。各科的基本特征分别为:原毛虫科Phacodinidae无明确体棘毛和背触毛的分化;凯毛虫科Kitrichi dae体纤毛器背腹有明确分化,有原始的背触毛分化;旋毛虫科Spirofilidae腹棘毛旋列或斜向排列;卡尔虫科K