愈伤组织形成过程中,各个发育时期以细胞形态和代谢状况的变化为其特征。在诱导期或起动期,外植体伤口表面逐步通过回复变化转变为分生组织状态,表现为细胞核和核仁增大以及 RNA 的积累,其结果导致细胞的脱分化。之后,继以分裂期,其特征为 RNA 的大量积累和活跃的细胞分裂。这样,外层组织已完成起动,并已变为分生组织,就不能把分裂期认为回复变化或脱分化的时期。木本植物外植体表面普遍地可发生瘤状愈伤组织,它起源于距外植体切口较远的各个部分,特别包括表皮和下皮。愈伤组织培养中普遍地有分生组织结节的存在,它起源于个别薄壁细胞经脱分化而来。分生组织结节可继续分化为内部是管胞,外围形成层状细胞的维管组织结节。分生组织结节或维管组织结节在具有单向极性生长时形成根原基。不定芽一般从外生或内生的分生细胞团分化而来,但有时芽原基的分化与分生组织结节或维管组织结节相关联。