水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位

被引：12

作者：

刘斌美 ^{[1
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吴跃进 ^{[1
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童继平 ^{[2
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吴敬德 ^{[2
]}

余增亮 ^{[1
]}

张瑛 ^{[1
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程灿 ^{[3
]}

机构：

[1] 中国科学院安徽省离子束生物工程学重点实验室

[2] 安徽省农业科学院水稻研究所

[3] 上海市农业科学院作物所

来源：

作物学报 | 2006年 / 03期

基金：

安徽省自然科学基金;

关键词：

水稻; 半矮秆突变体; 显性基因; SCAR; 基因定位;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

粳稻品系Y98149是从离子束诱变的后代中获得的显性半矮秆突变体,与野生型Y98148是1对株高近等基因系。将已经获得的3个与水稻显性半矮秆基因紧密连锁的RAPD标记分别克隆、测序,根据测序结果设计了3对特异性PCR引物,成功地将RAPD标记S1041525、S1076549和S1272403转化成更稳定的SCAR标记SCS1041498、SCS1076510和SCS1272388。通过Y98148×Y98149的F2代分离群体的分析,这3个SCAR标记与显性半矮秆基因的遗传距离分别为12.6cM、7.5 cM和16.3 cM,且位于基因的同一侧。序列同源性比较表明,标记S1272403为单拷贝,其核苷酸序列与水稻第7染色体上2个BAC克隆B1249D05(AP006451)和OJ1212-C12(AP005604)同源性为99%,B1249D05与OJ1212-C12有23 kb的重叠区域,标记S1272403位于这个重叠区域,据此初步将显性半矮秆基因定位,为进一步精确定位和图位克隆奠定了基础。

引用

页码：449 / 454

页数：6

共 13 条

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