发生马铃薯立枯病土壤中立枯丝核菌的荧光定量PCR快速检测

被引：27

作者：

李瑞琴 ^{[1
,2
]}

刘星 ^{[1
,3
,4
]}

邱慧珍 ^{[1
,3
,4
]}

张文明 ^{[1
,3
,4
]}

张春红 ^{[1
,3
,4
]}

王蒂 ^{[3
,4
,5
]}

张俊莲 ^{[3
,4
,5
]}

沈其荣 ^{[6
]}

机构：

[1] 甘肃农业大学资源与环境学院

[2] 甘肃省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所

[3] 甘肃省干旱生境作物学重点实验室

[4] 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室

[5] 甘肃农业大学农学院

[6] 南京农业大学资源与环境学院

来源：

草业学报 | 2013年 / 22卷 / 05期

关键词：

连作马铃薯根际土壤; 立枯丝核菌; 实时荧光定量PCR; 动态变化趋势;

D O I：

暂无

中图分类号：

S435.32 [马铃薯（土豆）病虫害];

学科分类号：

090401 ; 090402 ;

摘要：

连作马铃薯根际土壤中立枯丝核菌的大量累积可能是导致马铃薯连作障碍发生的主要原因之一。为了解根际土壤中土传病害病原菌的积累与连作障碍之间的关系,进一步寻求缓解和克服马铃薯连作障碍土传病害的有效途径,本研究建立优化了荧光定量PCR(real-time PCR)方法,对引起马铃薯立枯病的病原菌立枯丝核菌进行了快速监测和绝对定量,对马铃薯连作1～5年根际土壤立枯丝核菌的动态变化趋势进行了检测分析。结果显示,研究建立优化的荧光定量PCR检测方法,可直接应用土壤DNA进行病原菌的定量检测,能检测到土壤中浓度为1×102个拷贝/g土的马铃薯立枯丝核菌,扩增效率为1.04,具有检出限低、扩增效率高的特点,实现了不通过病土分离培养方法,就可掌握病原菌在根际土壤中的累积状况;在马铃薯立枯病发病严重的连作根际土壤中,立枯丝核菌的累积数量随连作年限的递增呈上升趋势;病原菌的累积随生育进程的推进呈下降趋势;病原菌累积量最大的是连作5年的播前土壤,每g土壤达3.75×107个拷贝数,由此可见,连作导致了土壤微生物种群结构发生改变,土壤致病真菌数量增加,相应地也增加了马铃薯立枯病的初侵染机率。

引用

页码：136 / 144

页数：9

共 38 条

[1]

Detection and Quantification of <Emphasis Type="Italic">Spongospora subterranea</Emphasis> in Soil; Water and Plant Tissue Samples Using Real-Time PCR.[J].Pieter van de Graaf;Alison K. Lees;Danny W. Cullen;James M. Duncan.European Journal of Plant Pathology.2003, 6

[2] Detection of Colletotrichum coccodes from soil and potato tubers by conventional and quantitative real-time PCR [J].

Cullen, DW ;

Lees, AK ;

Toth, IK ;

Duncan, JM .

PLANT PATHOLOGY, 2002, 51 (03) :281-292

[3] Development of conventional and quantitative real-time PCR assays for the detection and identification of Rhizoctonia solani AG-3 in potato and soil [J].

Lees, AK ;

Cullen, DW ;

Sullivan, L ;

Nicolson, MJ .

PLANT PATHOLOGY, 2002, 51 (03) :293-302

[4] Conventional PCR and real-time quantitative PCR detection of Helminthosporium solani in soil and on potato tubers [J].

Cullen, DW ;

Lees, AK ;

Toth, IK ;

Duncan, JM .

EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY, 2001, 107 (04) :387-398

[5]

Pathology and control of soil-borne fungal pathogens of potato.[J].M. J. Jeger;G. A. Hide;P. H. J. F. Boogert;A. J. Termorshuizen;P. Baarlen.Potato Research.1996, 3

[6]

土壤与环境微生物研究法.[M].李振高; 骆永明; 滕应; 编著.科学出版社.2008,

[7]

现代微生物生物技术.[M].周世宁; 主编.高等教育出版社.2007,

[8]

马铃薯有害生物及其检疫.[M].姚文国;崔茂森主编;.中国农业出版社.2001,

[9] 连作马铃薯根际土壤真菌种群结构及其生物效应 [J].

孟品品 ;

刘星 ;

邱慧珍 ;

张文明 ;

张春红 ;

王蒂 ;

张俊莲 ;

沈其荣 .

应用生态学报 , 2012, (11) :3079-3086

[10] 马铃薯黑痣病菌菌丝融合群的鉴定 [J].

田晓燕 ;

蒙美莲 ;

张笑宇 ;

董瑞利 ;

胡俊 .

中国马铃薯, 2011, 25 (05) :298-301

← 1 2 3 4 →