茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

被引：101

作者：

孙美莲 ^{[1
]}

王云生 ^{[2
]}

杨冬青 ^{[1
]}

韦朝领 ^{[1
]}

高丽萍 ^{[2
]}

夏涛 ^{[1
]}

单育 ^{[1
]}

骆洋 ^{[2
]}

机构：

[1] 安徽农业大学农业部茶叶生物化学与生物技术重点实验室

[2] 安徽农业大学生命科学学院

来源：

植物学报 | 2010年 / 45卷 / 05期

基金：

安徽省自然科学基金;

关键词：

茶树; 实时荧光定量PCR; 内参基因;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q943.2 [植物基因工程];

学科分类号：

071007 ; 090102 ;

摘要：

选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR分析(qRT-PCR)准确性的先决条件。该文以茶树(Camellia sinensis)芽、叶、幼根、嫩茎、花瓣、种子和愈伤组织为材料,应用实时荧光定量PCR技术,分析了18S rRNA、GAPDH、β-actin和α-tubulin4个常用内参基因在茶树不同器官组织中的表达情况。经GeNorm和NormFinder软件分析发现,当利用荧光定量PCR分析比较茶树不同器官组织中的基因表达差异时,可选择β-actin作为校正内参基因;而比较不同成熟度的叶片和愈伤组织时,可以选择GAPDH作为校正内参基因。

引用

页码：579 / 587

页数：9

共 18 条

[1]

茶树查尔酮异构酶、黄酮醇合成酶和无色花色素还原酶等基因的克隆与表达分析.[D].马春雷.中国农业科学院.2007, 05

[2] Reference genes for quantitative analysis on Clonorchis sinensis gene expression by real-time PCR [J].

Yoo, Won Gi ;

Kim, Tae Im ;

Li, Shunyu ;

Kwon, Oh Sil ;

Cho, Pyo Yun ;

Kim, Tong-Soo ;

Kim, Kijeong ;

Hong, Sung-Jong .

PARASITOLOGY RESEARCH, 2009, 104 (02) :321-328

[3]

Housekeeping gene selection for quantitative real‐time PCR assays in the seagrass Zostera marina subjected to heat stress.[J].Vanessa Ransbotyn;Thorsten B.H. Reusch.Limnology and Oceanography: Methods.2006, 10

[4] Validation of housekeeping genes as internal control for studying gene expression in rice by quantitative real-time PCR [J].

Jain, Mukesh ;

Nijhawan, Aashima ;

Tyagi, Akhilesh K. ;

Khurana, Jitendra P. .

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2006, 345 (02) :646-651

[5]

Optimized RT-PCR Method for Assaying Expression of Monocyte Chemotactic Protein Type 1 (MCP-1) in Rabbit Aorta.[J].B. S?kalska;A. Ciechanowicz;B. Do??gowska;M. Naruszewicz.Biochemical Genetics.2006, 3

[6] Beneficial effects of green tea -: A review [J].

Cabrera, C ;

Artacho, R ;

Giménez, R .

JOURNAL OF THE AMERICAN COLLEGE OF NUTRITION, 2006, 25 (02) :79-99

[7]

Real-time PCR method for the quantitative analysis of human T-cell receptor γ and β gene rearrangements.[J].J.L. Chain;M.L. Joachims;S.W. Hooker;A.B. Laurent;C.K. Knott-Craig;L.F. Thompson.Journal of Immunological Methods.2005, 1

[8] Real Time RT-PCR for the detection and quantitation of bovine respiratory syncytial virus [J].