海水养殖沉积环境微生物总DNA的提取方法研究

被引：16

作者：

傅莲英 ^{[1
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席峰 ^{[2
]}

袁建军 ^{[3
]}

王桂忠 ^{[4
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田蕴 ^{[1
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郑天凌 ^{[1
]}

机构：

[1] 厦门大学生命科学学院环境微生物研究所

[2] 集美大学水产生物技术研究所

[3] 泉州师范学院生物学系

[4] 厦门大学海洋与环境学院近海海洋环境科学国家重点实验室

来源：

厦门大学学报(自然科学版) | 2006年 / 06期

关键词：

虾池; DNA提取; PCR; 限制酶切; DGGE;

D O I：

暂无

中图分类号：

S917.1 [水产微生物学];

学科分类号：

摘要：

传统的微生物分离与培养技术无法揭示微生物群落的动态变化.为了阐释虾池沉积环境微生态格局的原始组成情况,本研究先以TENP缓冲液去除沉积物中的腐殖酸,继之以溶菌酶-SDS温和裂解,其总DNA的提取效率达90%以上,所获DNA产量达2～20μg/g沉积物(湿),片段大小均在23 kb左右,不经纯化即可直接进行PCR扩增和限制性酶切.以该DNA为模板进行PCR-DGGE分析,揭示了虾池沉积物丰富的微生物多样性.该方法是一种适用于虾池沉积物总DNA提取的简便、可靠方法.

引用

页码：841 / 846

页数：6

共 3 条

[1] 施用芽孢杆菌对虾池底泥细菌群落的影响 [J].

林亮 ;

李卓佳 ;

郭志勋 ;

杨莺莺 ;

林小涛 ;

贾晓平 .

生态学杂志, 2005, (01) :26-29

[2] 老化虾池生态系中几类主要细菌的季节变化特征 [J].

李秋芬 ;

曲克明 ;

陈碧鹃 ;

孙修涛 ;

李健 ;

赵法箴 ;

袁有宪 .

海洋水产研究, 2002, (02) :12-18

[3]

Application of denaturing gradient gel electrophoresis （DGGE） and temperature gradient gel electrophoresis （TGGE） in microbial ecology[J] . Gerard Muyzer,Kornelia Smalla.Antonie van Leeuwenhoek . 1998 (1)

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