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用细胞色素b部分序列研究斑马鱼的分子分类与系统发育
被引:26
作者:
项方
邹记兴
邓凤姣
刘思阳
隋阳
机构:
[1] 武汉大学生命科学学院发育生物学教育部重点实验室
[2] 中国科学院南海海洋研究所
来源:
关键词:
斑马鱼;
分子分类;
系统发育;
细胞色素b;
D O I:
10.13859/j.cjz.2004.05.004
中图分类号:
Q959 [动物分类学(系统动物学)];
学科分类号:
摘要:
用细胞色素b特异性引物 ,对长尾斑马鱼、短尾斑马鱼、豹纹斑马鱼、食蚊鱼和青石斑鱼的总DNA进行PCR扩增、克隆、测序后与Genbank数据库的团头鲂、青鱼、草鱼、金桔鱼的细胞色素b基因同源序列进行序列比较。结果显示 ,长度为 42 6bp的细胞色素b同源序列的平均碱基组成是 :2 6 7%A ,2 6 1 %C ,1 6 6%G ,3 0 5 %T ,密码子第三位点的碱基组成存在较大的偏倚 ,G的含量仅占 6 4%。长尾斑马鱼、短尾斑马鱼和豹纹斑马鱼之间细胞色素bDNA序列变异很小 ,相似性高于 99%。NJ法构建的分子系统树表明 :豹纹斑马鱼先与长尾斑马鱼聚在一起 ,再与短尾斑马鱼聚为一组。本研究结果支持Frankel和David等人认为豹纹斑马鱼应该是Daniorerio的一个亚种 ,而不是单独的一个种的观点。
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