堆肥未培养细菌的宏基因组文库构建及新的木聚糖酶基因的克隆和鉴定

被引：6

作者：

张鹏 ^{[1
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段承杰 ^{[1
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庞浩 ^{[2
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封毅 ^{[2
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靳振江 ^{[2
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许跃强 ^{[2
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莫新春 ^{[2
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唐纪良 ^{[1
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冯家勋 ^{[1
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机构：

[1] 广西亚热带生物资源保护利用重点实验室(广西大学)

[2] 广西大学生命科学与技术学院

来源：

广西科学 | 2005年 / 04期

关键词：

细菌; 宏基因组文库; 木聚糖酶基因;

D O I：

10.13656/j.cnki.gxkx.2005.04.030

中图分类号：

Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

从自制堆肥样品中提取未培养细菌的总DNA,用柯斯质粒pW EB∷TNC为载体构建宏基因组文库,对文库进行筛选获得表达木聚糖酶活性的克隆,再进行亚克隆、测序分析以及B lastx搜索G enB ank分析木聚糖酶基因。结果构建得到一个包含约5万个克隆的宏基因组文库,文库中外源DNA总容量约为1.8×106kb,获得2个表达木聚糖酶活性的克隆:pGXN 1050和pGXN 1051,鉴定分析表明:pGXN 1050上潜在的木聚糖酶基因um xyn 11A具1个771bp的ORF(Open R ead ing F ram e),可编码含257个氨基酸的蛋白质,所编码产物与混合纤维弧菌(C ellv ibr io m ix tus)的内切-1,4-β-木聚糖酶(G enB ank索引号Z48925.1)的氨基酸序列有46%的一致性和57%的相似性;pGXN 1051上潜在的木聚糖酶基因um xyn 11B具一个723bp的ORF,可编码含241个氨基酸的蛋白质,编码产物与混合纤维弧菌的内切-1,4-β-木聚糖酶(G enB ank索引号Z48925.1)的氨基酸序列有73%的一致性和80%的相似性。木聚糖酶Um xyn11A和Um xyn11B都属于糖基水解酶家族11的成员。

引用

页码：343 / 346+352 +352

页数：5

共 3 条

[1]

罗宇煊,张甲耀,马瑛.有害废物堆肥技术及堆肥生态系统研究进展[J].上海环境科学,1999(10)

[2]

罗宇煊,张甲耀,马瑛.有害废物堆肥技术及堆肥生态系统研究进展[J].上海环境科学,1999(10)

[3] 城市生活垃圾堆肥化处理 [J].

陈世和 .

环境污染与防治, 1985, (04) :29-34

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