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基于链接聚类的代谢网络社团结构研究
被引:2
作者
:
论文数:
引用数:
h-index:
机构:
丁德武
[
1
]
论文数:
引用数:
h-index:
机构:
吴璞
[
1
,
2
]
计博婧
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
池州学院数学与计算机科学系
南京邮电大学计算机学院
池州学院数学与计算机科学系
计博婧
[
1
,
2
]
王汝传
论文数:
0
引用数:
0
h-index:
0
机构:
南京邮电大学计算机学院
池州学院数学与计算机科学系
王汝传
[
2
]
机构
:
[1]
池州学院数学与计算机科学系
[2]
南京邮电大学计算机学院
来源
:
计算机工程与应用
|
2011年
/ 47卷
/ 34期
关键词
:
社团结构;
功能模块;
链接聚类;
代谢网络;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
Q811.4 [生物信息论];
O157.5 [图论];
学科分类号
:
0711 ;
0831 ;
070104 ;
摘要
:
社团结构分析有助于识别代谢网络中的功能模块,有助于理解代谢网络的结构和功能关系,是代谢网络研究领域的一个重要研究课题。然而,当前的社团结构分析方法均依赖于对网络中的节点进行聚类分析,导致每个节点只能属于某一个社团。采用了一种对复杂网络中的链接进行聚类分析的方法,对高质量金黄色葡萄球菌代谢网络模型的巨强连通体进行了社团结构分析,得到了10个具有生物学意义的功能模块,结果表明链接聚类可用于识别新陈代谢网络中的功能社团。
引用
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页数:4
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共 2 条
[1]
Protein Interaction Networks-More Than Mere Modules
[J].
Pinkert, Stefan
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机构:
Univ Wurzburg, Dept Bioinformat, Bioctr, Wurzburg, Germany
Max Planck Inst Biochem, Dept Cellular Biochem, D-82152 Martinsried, Germany
Univ Wurzburg, Dept Bioinformat, Bioctr, Wurzburg, Germany
Pinkert, Stefan
;
Schultz, Joerg
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机构:
Univ Wurzburg, Dept Bioinformat, Bioctr, Wurzburg, Germany
Univ Wurzburg, Dept Bioinformat, Bioctr, Wurzburg, Germany
Schultz, Joerg
;
Reichardt, Joerg
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0
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机构:
Univ Wurzburg, Inst Theoret Phys & Astrophys, Wurzburg, Germany
Univ Calif Davis, Complex Sci Ctr, Davis, CA 95616 USA
Univ Wurzburg, Dept Bioinformat, Bioctr, Wurzburg, Germany
Reichardt, Joerg
.
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY,
2010,
6
(01)
[2]
The model organism as a system:inte-grating"Omics"data sets .2 Joyce A R,Palsson B O. Nat Rev Mol Cell Biol . 2006
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Pinkert, Stefan
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Pinkert, Stefan
;
Schultz, Joerg
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;
Reichardt, Joerg
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Univ Wurzburg, Inst Theoret Phys & Astrophys, Wurzburg, Germany
Univ Calif Davis, Complex Sci Ctr, Davis, CA 95616 USA
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Reichardt, Joerg
.
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY,
2010,
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