生物陶粒与生物活性炭上微生物群落结构的PCR-SSCP技术解析

被引：10

作者：

刘小琳

刘文君

机构：

[1] 清华大学环境科学与工程系

来源：

环境科学 | 2007年 / 04期

关键词：

生物陶粒; 生物活性炭; 微生物群落; 群落结构; 单链构象多态性;

D O I：

10.13227/j.hjkx.2007.04.041

中图分类号：

TU991 [给水工程（上水道工程）];

学科分类号：

0815 ;

摘要：

采用PCR-SSCP(单链构象多态性)技术,以16S rRNA基因的V4-V5区为靶对象,分析用于饮用水处理的生物陶粒和生物活性炭上的微生物群落结构.对生物陶粒和生物活性炭上的微生物分别进行超声波洗脱、R2A和LB平板培养后提取基因组DNA.结果表明,除生物活性炭超声波洗脱不能提取到DNA外,其他处理均能提取到大小在10 kb以上的基因组DNA,但所提取的量有较大差异.以提取的DNA为模板分别进行PCR,均能扩增到408 bp的基因片段.这些片段经λ核酸外切酶消化处理后进行SSCP电泳.结果显示,超声波洗脱、R2A和LB培养对试验结果影响不明显.生物陶粒的微生物基因扩增片段SSCP图谱相同,且只出现1条带.测序后与基因组数据库对比,结果显示其与uncultured Pseudomonas sp.clone FTL201 16S rDNA(GenBank登录号AF509293.1)片段同源性为92%.生物活性炭的微生物基因扩增片段SSCP图谱也相同,但有2条带.测序对比的结果表明,这2个基因片段与Bacillus sp.JH19 16S rDNA(GenBank登录号DQ232748.1)片段和Bacterium VA-S-11 16S rDNA(GenBank登录号AY395279.1)片段的同源性分别为100%和99%.

引用

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页数：5

共 4 条

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