羌活药材ITS/ITS2条形码鉴定及其稳定性与准确性研究

被引：119

作者：

辛天怡

姚辉

罗焜

向丽

马晓冲

韩建萍

林余霖

宋经元

陈士林

机构：

[1] 中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,濒危药材繁育国家工程实验室

来源：

药学学报 | 2012年 / 08期

基金：

国家高技术研究发展计划(863计划);

关键词：

羌活; ITS/ITS2; 物种鉴定; 稳定性; 准确性;

D O I：

暂无

中图分类号：

R282.5 [药材鉴定];

学科分类号：

100803 [中药鉴定学];

摘要：

为验证DNA条形码鉴定的稳定性与准确性,本文选用羌活药材作为研究对象,对31份样本提取基因组DNA,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列并进行双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,采用MEGA5.0软件与其混伪品进行序列比对,计算种内和种间距离,构建邻接树(neighbor-joining tree,NJ Tree)。ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMMer)的注释方法获得。结果表明,羌活药材ITS序列长度为603～604 bp,ITS2序列长度均为228 bp,羌活药材ITS/ITS2序列单倍型与其基原植物叶片序列一致。两种基原植物ITS/ITS2序列种内平均kimura 2-parameter(K2P)遗传距离均远远小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离;NJ树结果显示羌活、宽叶羌活与其混伪品均可明显区分,表现出良好单系性。因此ITS/ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别羌活药材,为保障临床安全用药提供了新的技术手段。

引用

页码：1098 / 1105

页数：8

共 6 条

[1]

Using DNA Barcoding to Identify Species within Euphorbiaceae[J] Xiaohui Pang;Jingyuan Song;Yingjie Zhu;Caixiang Xie;Shilin Chen Planta Med 2010,

[2]

Identification of medicinal plants in the family Fabaceae using a potential DNA barcode ITS2[J] Ting Gao;Hui Yao;Jingyuan Song;Chang Liu;Yingjie Zhu;Xinye Ma;Xiaohui Pang;Hongxi Xu;Shilin Chen Journal of Ethnopharmacology 2010,

[3]

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[4]

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[5]

Pan-eukaryote ITS2 homologies revealed by RNA secondary structure Coleman A W; NuclAcids Res 2007,

[6]

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