红斑丹毒丝菌SpaA抗原基因的克隆、序列分析及蛋白结构预测

被引：6

作者：

李伟杰

赵耘

康凯

岂晓鑫

杜昕波

陈敏

机构：

[1] 中国兽医药品监察所

来源：

中国兽医学报 | 2011年 / 11期

关键词：

红斑丹毒丝菌; SpaA基因; 克隆和序列分析; 结构预测;

D O I：

10.16303/j.cnki.1005-4545.2011.11.011

中图分类号：

Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

参照红斑丹毒丝菌表面抗原A(SpaA)基因的核苷酸序列合成1对引物,对我国生产用红斑丹毒丝菌CVCC43005的SpaA全基因进行了PCR扩增,扩增产物连接到pMD18-T载体上,进行序列测定和分析。结果表明,SpaA基因全长1 881bp,含有1个开放性阅读框,编码626个氨基酸。与已提交的红斑丹毒丝菌血清型1a、1b、2a、2b、5、8、9、12、15、16、17、N型的氨基酸同源性为97.5%～100%,血清型4、6、11、19、21的氨基酸同源性为52.8%～55.2%。与已提交的丹毒丝菌血清型18的氨基酸同源性为57.5%～58.0%。采用Chou-Fasman和Karplus-Schulz方案预测蛋白质的二级结构和柔性区域;运用Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性,按Jame-son-Wolf方案预测抗原指数,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性。对预测结果综合分析,推测最有可能的B细胞表位位于N端的59～64、85～91、174～186、193～201、212～215、221～231、266～275、278～288、291～308、314～327、329～349、356～376、403～456、508～516、528～537、568～576和607～626。

引用

页码：1631 / 1634+1639 +1639

页数：5

共 6 条

[1]

Evaluation of Erysipelothrix rhusiopathiae vaccines in pigs by intradermal challenge and immune responses[J] . G.J. Eamens,J.C. Chin,B. Turner,I. Barchia.Veterinary Microbiology . 2006 (1)

[2] Characterisation of Erysipelothrix rhusiopathiae isolates from pigs associated with vaccine breakdowns [J].

Eamens, G. J. ;

Forbes, W. A. ;

Djordjevic, S. P. .

VETERINARY MICROBIOLOGY, 2006, 115 (04) :329-338

[3]

Efficacy of vaccines against bacterial diseases in swine: what can we expect?[J] . Freddy Haesebrouck,Frank Pasmans,Koen Chiers,Dominiek Maes,Richard Ducatelle,Annemie Decostere.Veterinary Microbiology . 2004 (3)

[4] Protective immunity of SpaA-antigen producing Lactococcus lactis against Erysipelothrix rhusiopathiae infection [J].

Cheun, HI ;

Kawamoto, K ;

Hiramatsu, M ;

Tamaoki, H ;

Shirahata, T ;

Igimi, S ;

Makino, SI .

JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, 2004, 96 (06) :1347-1353

[5]

Surface antigen, SpaA, of Erysipelothrix rhusiopathiae binds to Gram-positive bacterial cell surfaces[J] . Sou-ichi Makino,Kensyu Yamamoto,Hiroshi Asakura,Toshikazu Shirahata.FEMS Microbiology Letters . 2000 (2)

[6]

Properties of repeat domain found in a novel protective antigen, SpaA, of Erysipelothrix rhusiopathiae[J] . Sou-ichi Makino,Kensyu Yamamoto,Shuichi Murakami,Toshikazu Shirahata,Keiichi Uemura,Takuo Sawada,Hiroaki Wakamoto,Yutaka Morita.Microbial Pathogenesis . 1998 (2)

← 1 →