水稻矮缩病毒基因组第六号片段编码区的cDNA克隆及序列分析

从水稻矮缩病毒（ＲｉｃｅＤｗａｒｆＶｉｒｕｓ，ＲＤＶ）中国福建分离物的基因组中分离出第六号　　　片段的双链ＲＮＡ，根据已发表的日本分离物第六号片段ｃＤＮＡ全序列合成了两个寡聚核苷酸引物，经过逆转录合成ｃＤＮＡ，应用ＰＣＲ方法扩增了编码区的基因序列，并将扩增产物克隆到ｐＧＥＭ３Ｚｆ（一）载体上。对重组子进行的限制性酶切分析和ＤＮＡ序列分析证明，得到的是ＲＤＶ第六号片段完整的编码序列，进而构建了亚克隆并进行了全序列测定。结果表明，我们所扩增和克隆的片段长１５７９ｂｐ，包含了第六号片段的长１５３Ｏｂｐ的阅读框架部分，编码一个由５０９个氨基酸组成的蛋白质，与日本分离物相应序列相比较有较高的同源性，核苷酸序列及由此推算出的氨基酸序列的同源率分别为９６．７％和９８．８％。