针对工程方案设计的主观性问题,探讨了模糊综合评价与数据包络分析(DEA)理论在工程方案设计选择中的应用。将综合评价指标分为可定性分析指标和可定量分析指标,不同的评价指标采用不同的评价方法进行分析。对于可定性分析指标,采用离散语言值标尺确定单因素评价向量;对于可定量分析指标,应用数理统计与模糊数学相结合的方法,根据离散抽样模型,定量计算单因素评价向量。通过定性与定量分析相结合,采用模糊综合评价进行工程方案设计。同时将DEA分析理论应用于工程方案设计问题,构建了适合于方案设计的DEA模型,研究了设计方案的相对有效性。实例证明,该方法在水利设计等工程领域具有很强的实用性。