启东肝癌高发区乙肝病毒流行株全基因分析

被引：7

作者：

郭霞 ^{[1
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金晏 ^{[2
]}

钱耕荪 ^{[2
]}

许丽 ^{[2
]}

屠红 ^{[2
]}

机构：

[1] 复旦大学公共卫生学院

[2] 上海交通大学肿瘤研究所分子诊断室

来源：

肿瘤 | 2007年 / 06期

关键词：

肝肿瘤; 肝炎，乙型; 基因，病毒; 点突变;

D O I：

暂无

中图分类号：

R735.7 [肝肿瘤];

学科分类号：

摘要：

目的:通过对江苏启东地区乙型肝炎病毒(HBV)全基因序列的分析,探讨该地区肝癌高发的分子病毒学病因。方法:以蛋白酶K消化后,酚/氯仿抽提7例肝炎和7例肝癌患者血清中DNA。应用聚合酶链反应(PCR),扩增血清中HBV基因全长,克隆至T载体后行全自动测序。以PHYLIP软件构建的系统进化树判断HBV的基因型;以Clastal W软件对序列进行突变分析。结果:14例标本中有12例为C基因型,2例为B基因型。肝癌和肝炎组中HBV基因型类别分布无差异。有5例HBV发生了PreS2的缺失突变,其中肝癌标本4例(57.1%),肝炎标本仅1例(14.3%)。HBV基因组中常见的点突变为PreS1区的nt.3116及核心启动子区的nt.1762/1764,发生率高达78.6%(11/14)。与肝炎组相比,肝癌中点突变发生率显著增高的位点为前C区nt.1899 G→A的突变(P=0.01)及核心启动子区nt.1653 C→T的突变(P=0.05)。结论:启东地区HBV以C基因型为主;启东HBV基因组中可能存在着与肝癌相关的点突变和缺失突变。

引用

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