广西首起诺如病毒感染性腹泻病原基因测序分析

被引:15
作者
刘巍 [1 ]
隆文杰 [2 ]
石玲玲 [2 ]
董柏青 [1 ]
邓丽丽 [1 ]
农梁伟 [3 ]
黄春光 [1 ]
黄丽华 [1 ]
李艳 [1 ]
杨进业 [1 ]
机构
[1] 广西壮族自治区疾病预防控制中心
[2] 广西大学生命科学学院
[3] 广西大新县疾病预防控制中心
关键词
诺如病毒; Real-time RT-PCR; 进化树分析;
D O I
暂无
中图分类号
R512.5 [肠道病毒感染];
学科分类号
摘要
目的对广西首起诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确证其病原体,并对其基因分型。方法采用荧光定量PCR法对8份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,取其中4份阳性标本再经RT-PCR扩增,然后纯化、克隆、测序和进化树分析。结果8份标本均测出诺如病毒RNA,阳性率100%;其中4株病毒的N/S区序列与GenBank中的雪山病毒参考株同源性最高,达95%。结论序列测定结果证实广西大新县的急性胃肠炎疫情是诺如病毒感染所致,其病毒基因型为GⅡ.2型。
引用
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共 1 条
  • [1] Molecular epidemiology and phylogenetic analysis of Sapporo-like viruses[J] . M. Okada,K. Shinozaki,T. Ogawa,I. Kaiho.Archives of Virology . 2002 (7)