采用ARDRA研究双孢蘑菇培养料后发酵过程中的细菌群落结构(Ⅰ)——细菌16S rDNA全长文库的建立

被引:4
作者
何丽鸿 [1 ,2 ]
于荣利 [1 ]
陈明杰 [1 ]
潘迎捷 [3 ]
机构
[1] 中华人民共和国农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室,上海市食用菌工程技术研究中心,上海市农业遗传育种重点实验室,上海市农业科学院食用菌研究所
[2] 南京农业大学生命科学院微生物系
[3] 上海海洋大学
关键词
双孢蘑菇; 培养料后发酵; 细菌16S rDNA文库;
D O I
10.16488/j.cnki.1005-9873.2008.04.007
中图分类号
S646.1 [褶伞菌];
学科分类号
090202 ;
摘要
采用化学裂解和酶解相结合的方法,以加入PVPP的高盐缓冲液作为细胞裂解反应体系,用PEG- 8000进行DNA沉淀.从双孢蘑菇堆肥后发酵的4个代表时期培养料样品中提取微生物总DNA,再以总DNA为模板,以专用引物F27和R1498进行PCR扩增,获得16S rDNA片段,经纯化后构建4个时期样品的细菌16S rDNA文库。试验结果表明,本试验获得的总DNA质量较好。采用PCR扩增可获得多个细菌、放线菌和真菌特异片段;细菌16S rDNA文库的目的片段插入效率在90%以上。
引用
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共 1 条
[1]   Evaluation of extraction and purification methods for obtaining PCR-amplifiable DNA from compost for microbial community analysis [J].
LaMontagne, MG ;
Michel, FC ;
Holden, PA ;
Reddy, CA .
JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, 2002, 49 (03) :255-264