基于Meta分析的大豆百粒重的QTLs定位

被引：19

作者：

齐照明 ^{[1
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孙亚男 ^{[1
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陈立君 ^{[2
]}

郭强 ^{[2
]}

刘春燕 ^{[1
,3
]}

胡国华 ^{[3
]}

陈庆山 ^{[1
]}

机构：

[1] 东北农业大学农学院

[2] 黑龙江省农业科学院作物育种研究所

[3] 黑龙江省农垦科研育种中心

来源：

中国农业科学 | 2009年 / 42卷 / 11期

关键词：

大豆; 百粒重; Meta分析; 通用QTL; MAS;

D O I：

暂无

中图分类号：

S565.1 [大豆];

学科分类号：

摘要：

【目的】百粒重是控制大豆产量性状的主要数量性状,对大豆产量性状进行基因定位具有重要的研究和应用价值。现有百粒重QTL定位结果分散,需选择合适的公共图谱,整合前人的研究结果,使其真正应用到实践中。【方法】以2004年发布大豆公共遗传连锁图谱soymap2为参考图谱,将近20年不同试验中的大豆百粒重的QTLs进行映射整合,构建百粒重QTL综合图谱。利用BioMercator2.1的映射功能将国内外常用的大豆图谱上的百粒重QTLs通过公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,并利用Meta分析,通过对比已经报道的QTLs的95%的置信区间来推断QTL位置,从而提取真正有效的QTL标记。【结果】在已经发表的文献中共找到65个百粒重QTLs定位信息,其中有53个QTLs定位区间与公共图谱有共有标记,包括36个增效效应的QTLs和17个减效效应的百粒重QTLs,共得到12个QTL簇,通过Meta分析,发掘出6个增效效应和6个减效效应的百粒重"通用QTLs"及其连锁标记。【结论】本研究得到的"通用QTLs"其置信区间最小可达到1.52cM,为辅助选择分子标记、QTL精细定位以及数量性状基因的克隆奠定基础。

引用

页码：3795 / 3803

页数：9

共 21 条

[1]

大豆遗传图谱构建及在两个群体重要农艺性状的QTL定位.[D].朱晓丽.东北农业大学.2006, 01

[2]

大豆SSR遗传图谱构建及重要农艺性状QTL分析.[D].王珍.广西大学.2004, 04

[3] 大豆百粒重与主要农艺性状的关联度及相关性分析 [J].