利用AFLP-银染分子标记技术,对40个茶树品种(系)进行遗传多样性与亲缘关系分析。选用多态性高、分辨力强的引物组合EACG/MAAC、EAGG/MAAG与EAGG/MAGT分别对供试材料的基因组DNA进行扩增,共获得226条清晰可辨的带,其中多态性带207条,多态位点百分率为91.59%,这表明供试品种资源在DNA水平上酶切位点的分布存在广泛的变异。40份资源所检出的位点平均有效等位基因数、平均基因多样度、平均Shannon信息指数,分别为1.59±0.09、0.35±0.04、0.53±0.05。应用SPSS软件计算遗传距离介于0.13~0.48之间,平均为0.32;UPGMA法将40份资源分成4个类群,从相似性系数分析了各品种资源间的亲缘关系。