一种面向临床领域时序知识图谱的链接预测模型

被引：53

作者：

陈德华 ^{[1
]}

殷苏娜 ^{[1
]}

乐嘉锦 ^{[1
]}

王梅 ^{[1
]}

潘乔 ^{[1
]}

朱立峰 ^{[2
]}

机构：

[1] 东华大学计算机科学与技术学院

[2] 上海交通大学医学院附属瑞金医院

来源：

计算机研究与发展 | 2017年 / 12期

关键词：

时序知识图谱; 知识图谱链接预测; 转换模型TransR; 长短期记忆网络; 增量学习;

D O I：

暂无

中图分类号：

R-05 [医学与其他学科的关系]; TP18 [人工智能理论];

学科分类号：

100117 [系统生物医学]; 140502 [人工智能];

摘要：

知识图谱(knowledge graph)链接预测可以解决知识图谱中缺失信息的发现和还原,是目前知识图谱领域的研究热点.传统的知识图谱链接预测方法大多面向静态的数据,并不适用于具有动态变化特性的时序知识图谱.时序知识图谱广泛存在于不同领域中,以临床医学领域为例,糖尿病作为一种典型的慢性病,其病程是一个疾病缓慢发展演化的过程.因此,在临床医学时序知识图谱上进行临床意义的链接预测,比如预测糖尿病的并发症,则需要考虑糖尿病病程发展随时间变化的时序特性,这也为传统的知识图谱链接预测方法带来巨大挑战.为此,结合临床医学事实知识的时序特性,提出一种基于LSTM序列增量学习的临床领域时序知识图谱链接预测模型.该模型结合LSTM长短期记忆单元递归神经网络在序列学习上的优势,通过构建基于LSTM的序列增量学习层,以端到端的方式提取时序知识图谱中的三元组时序特征,从而实现对时序知识图谱的链接预测.通过在糖尿病时序知识图谱上的实验,验证了模型的高效性、可用性及稳定性.

引用

页码：2687 / 2697

页数：11

共 10 条

[1]

中医药知识图谱构建与应用 [J].

阮彤 ;

孙程琳 ;

王昊奋 ;

方之家 ;

殷亦超 .

医学信息学杂志, 2016, 37 (04) :8-13

[2]

中医药知识图谱构建 [J].

贾李蓉 ;

刘静 ;

于彤 ;

董燕 ;

朱玲 ;

高博 ;

刘丽红 .

医学信息学杂志, 2015, 36 (08) :51-53+59

[3]

基于知识图谱的国际基因组流行病学可视化分析 [J].

王俏 ;

王伟 .

中华医学图书情报杂志, 2013, (04) :2-9

[4]

电子病历及其应用概述 [J].

刘丹红 ;

罗小楠 ;

徐勇勇 .

中国卫生质量管理, 2010, 17 (04) :2-5+1

[5]

Deep Learning in Visual Computing and Signal Processing[J] Danfeng Xie;Lei Zhang;Li Bai;Francesco Carlo Morabito Applied Computational Intelligence and Soft Compu 2017,

[6]

MorphoCol: An ontology-based knowledgebase for the characterisation of clinically significant bacterial colony morphologies[J] Ana Margarida Sousa;Maria Olívia Pereira;Anália Lourenço Journal of Biomedical Informatics 2015,

[7]

Ethics of Google's Knowledge Graph: some considerations[J] Katrine Juel Vang Journal of Information; Communication and Ethics in Society 2013,

[8]

DBpedia - A crystallization point for the Web of Data[J] Web Semantics: Science; Services and Agents on the World Wide Web 2009,

[9]

WordNet[J] George A. Miller Communications of the ACM 1995,

[10]

A knowledge-based modeling system for time-critical dynamic decision-making Xiang Y;Poh K L; Proc of the 9th Pacific Rim Int Conf on Artificial Intelligence 2006,

← 1 →